[ Source: cufflinks ]
Пакунок: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-9) [non-free]
Links for cufflinks
Debian Resources:
Download Source Package cufflinks:
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-9.dsc]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1.orig.tar.gz]
- [cufflinks_2.2.1+dfsg.1-9.debian.tar.xz]
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Charles Plessy (QA Page)
External Resources:
- Homepage [cufflinks.cbcb.umd.edu]
Similar packages:
Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.
This package provides the binary of cufflinks and associated tools, i.e. compress_gtf, cuffcompare, cuffdiff, cuffmerge, cuffnorm, cuffquant and gtf_to_sam.
Інші пакунки пов'язані з cufflinks
|
|
|
|
-
- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)
- serialization library for C++
-
- dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)
- portable C++ multi-threading
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- rec: gffread
- GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction
-
- enh: tophat
- Пакунок недоступний
Завантажити cufflinks
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| mips64el | 1,563.8 kB | 15,038.0 kB | [список файлів] |