[ bullseye ] [ bookworm ] [ trixie ] [ sid ]

[ Source: covtobed ]

Пакунок: covtobed (1.3.5+dfsg-1 and others)

Links for covtobed

Debian Resources:

Download Source Package covtobed:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Shayan Doust (QA Page)
Nilesh Patra (QA Page)

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Інші пакунки пов'язані з covtobed

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bamtools

toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.34)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Допоміжна бібліотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: zlib1g

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити covtobed

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
i386	1.3.5+dfsg-1+b1	51.5 kB	150.0 kB	[список файлів]