Пакунок: bedtools (2.30.0+dfsg-3)

Links for bedtools

Debian Resources:

Download Source Package bedtools:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з bedtools

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
dep: libc6 (>= 2.34)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

Допоміжна бібліотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Бібліотека стиснення даних у формат XZ
dep: libstdc++6 (>= 11)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити bedtools

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	649.1 kB	2,045.0 kB	[список файлів]
arm64	567.0 kB	1,877.0 kB	[список файлів]
armel	537.4 kB	1,748.0 kB	[список файлів]
armhf	554.1 kB	1,260.0 kB	[список файлів]
i386	717.1 kB	2,292.0 kB	[список файлів]
mips64el	582.2 kB	2,601.0 kB	[список файлів]
mipsel	601.8 kB	2,488.0 kB	[список файлів]
ppc64el	666.0 kB	2,517.0 kB	[список файлів]
s390x	567.4 kB	2,105.0 kB	[список файлів]