[ Source: prime-phylo ]
Пакунок: prime-phylo (1.0.11-10)
Links for prime-phylo
Debian Resources:
Download Source Package prime-phylo:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [prime.sbc.su.se]
Similar packages:
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.
The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.
Інші пакунки пов'язані з prime-phylo
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- Реалізації основних підпрограм лінійної алгебри (колективна бібліотека)
- or libblas.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libboost-mpi1.74.0 (>= 1.74.0)
- C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
-
- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)
- serialization library for C++
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: liblapack3
- Бібліотека підпрограм лінійної алгебри вер. 3 — колективна версія
- or liblapack.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libopenmpi3 (>= 4.1.0)
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: libxml2 (>= 2.7.4)
- XML бібліотека GNOME
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- sug: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- sug: mrbayes
- Bayesian Inference of Phylogeny
-
- sug: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- sug: njplot
- phylogenetic tree drawing program
-
- sug: phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- sug: probalign
- multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
-
- sug: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- sug: raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
-
- sug: treeviewx
- Displays and prints phylogenetic trees
Завантажити prime-phylo
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| armhf | 691.6 kB | 2,013.0 kB | [список файлів] |