[ Source: prokka ]
Пакунок: prokka (1.14.6+dfsg-4)
Links for prokka
Debian Resources:
Download Source Package prokka:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
External Resources:
- Homepage [www.vicbioinformatics.com]
Similar packages:
rapid annotation of prokaryotic genomes
A typical 4 Mbp genome can be fully annotated in less than 10 minutes on a quad-core computer, and scales well to 32 core SMP systems. It produces GFF3, GBK and SQN files that are ready for editing in Sequin and ultimately submitted to Genbank/DDJB/ENA.
Інші пакунки пов'язані з prokka
|
|
|
|
-
- dep: aragorn
- tRNA and tmRNA detection in nucleotide sequences
-
- dep: default-jre
- Standard Java or Java compatible Runtime
-
- dep: hmmer
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis
-
- dep: infernal
- inference of RNA secondary structural alignments
-
- dep: less
- Програма посторінкового виведення тексту (аналог more)
-
- dep: libbio-perl-perl
- BioPerl core perl modules
-
- dep: libbio-searchio-hmmer-perl
- perl parser for HMMER2 and HMMER3 output (hmmscan, hmmsearch, hmmpfam)
-
- dep: libswiss-perl
- Perl API to the UniProt database
-
- dep: libxml-simple-perl
- Perl module for reading and writing XML
-
- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: ncbi-tools-bin
- NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)
-
- dep: parallel
- паралельне виконнаня кількох команд зі стандартного вводу
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- dep: prodigal
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
Завантажити prokka
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 9,734.1 kB | 92,549.0 kB | [список файлів] |