tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: freecontact  ]

Paket: libfreecontact-dev (1.0.21-13.1 ve diğerleri)

libfreecontact-dev için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

freecontact Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

fast protein contact predictor library - development files

FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).

FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.

A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.

jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.

This package contains files necessary for developing applications with libfreecontact.

Etiketler: Yazılım Geliştirme: Kitaplıklar, Rol: Geliştirme Kitaplığı

libfreecontact-dev sağlayan paketler

libfreecontact-dev
fast protein contact predictor library - development files

libfreecontact-dev ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

libfreecontact-dev indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Sürüm Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
alpha (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1+b1 88,1 kB422,0 kB [dosya listesi]
amd64 1.0.21-13.1+b1 86,9 kB348,0 kB [dosya listesi]
arm64 1.0.21-13.1+b1 79,8 kB330,0 kB [dosya listesi]
armel 1.0.21-13.1+b1 73,9 kB306,0 kB [dosya listesi]
armhf 1.0.21-13.1+b1 73,5 kB270,0 kB [dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1 95,9 kB388,0 kB [dosya listesi]
i386 1.0.21-13.1+b1 74,7 kB275,0 kB [dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1+b1 108,7 kB494,0 kB [dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1+b1 67,4 kB262,0 kB [dosya listesi]
mips64el 1.0.21-13.1+b1 80,2 kB365,0 kB [dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1+b1 84,1 kB352,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 1.0.21-13.1+b1 93,9 kB358,0 kB [dosya listesi]
riscv64 1.0.21-13.1+b1 196,8 kB1.781,0 kB [dosya listesi]
s390x 1.0.21-13.1+b1 77,3 kB340,0 kB [dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1 86,1 kB255,0 kB [dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1+b2 70,3 kB329,0 kB [dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port) 1.0.21-13.1+b1 85,9 kB300,0 kB [dosya listesi]