Paket: miniasm (0.3+dfsg-4) [debports]

Länkar för miniasm

Debianresurser:

Felrapporter

Hämta källkodspaketet :

Hittades ej

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Andra paket besläktade med miniasm

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Hämta miniasm

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
sparc64 (inofficiell anpassning)	26,4 kbyte	1.044,0 kbyte	[filförteckning]