Paket: allelecount (4.3.0-2 och andra)

Länkar för allelecount

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

r-other-ascat
r-cran-pscbs
libmath-random-oo-perl
bamtools
gatb-core-testdata
gatb-core
libgatbcore-dev
libgatbcore3
libgatbcore2
r-cran-tigger
python3-covdefaults

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

Andra paket besläktade med allelecount

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats

Hämta allelecount

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
riscv64	4.3.0-2+b2	28,3 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]