alla flaggor
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Källkod: r-cran-spp  ]

Paket: r-cran-spp (1.16.0-2 och andra)

Länkar för r-cran-spp

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet r-cran-spp:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

GNU R ChIP-seq processing pipeline

R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data

 * Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate
   quality of tag alignment.
 * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags.
 * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them
   in WIG files for viewing in other browsers.
 * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical
   estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be
   exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of
   significant enrichment/depletion.
 * Determine statistically significant point binding positions
 * Assess whether the set of point binding positions detected at a
   current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not,
   estimate what sequencing depth would be required to do so.

Andra paket besläktade med r-cran-spp

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta r-cran-spp

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Version Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha (inofficiell anpassning) 1.16.0-2 316,0 kbyte473,0 kbyte [filförteckning]
amd64 1.16.0-2 315,3 kbyte453,0 kbyte [filförteckning]
arm64 1.16.0-2 309,7 kbyte425,0 kbyte [filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning) 1.16.0-2 320,3 kbyte461,0 kbyte [filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning) 1.16.0-2 332,4 kbyte597,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 1.16.0-2 308,7 kbyte452,0 kbyte [filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning) 1.16.0-2 316,9 kbyte499,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 1.16.0-2 317,2 kbyte497,0 kbyte [filförteckning]
riscv64 1.16.0-2+b1 312,3 kbyte401,0 kbyte [filförteckning]
s390x 1.16.0-2 311,0 kbyte444,0 kbyte [filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning) 1.16.0-2 332,8 kbyte439,0 kbyte [filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning) 1.15.5-1 307,6 kbyte431,0 kbyte [filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning) 1.16.0-2 316,0 kbyte441,0 kbyte [filförteckning]