Paket: r-bioc-decontam (1.22.0+dfsg-2)

Länkar för r-bioc-decontam

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet r-bioc-decontam:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [bioconductor.org]

Liknande paket:

identify contaminants in marker-gene and metagenomics sequencing sata

Simple statistical identification of contaminating sequence features in marker-gene or metagenomics data. Works on any kind of feature derived from environmental sequencing data (e.g. ASVs, OTUs, taxonomic groups, MAGs,...). Requires DNA quantitation data or sequenced negative control samples.

Andra paket besläktade med r-bioc-decontam

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: r-api-4.0

virtuellt paket som tillhandahålls av r-base-core
dep: r-api-bioc-3.18

virtuellt paket som tillhandahålls av r-bioc-biocgenerics
dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-phyloseq

GNU R handling and analysis of high-throughput microbiome census data
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-rmarkdown

convert R markdown documents into a variety of formats

Hämta r-bioc-decontam

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
all	204,4 kbyte	284,0 kbyte	[filförteckning]