alla flaggor
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Källkod: lagan  ]

Paket: lagan (2.0-10)

Länkar för lagan

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet lagan:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andra paket besläktade med lagan

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta lagan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha (inofficiell anpassning) 178,8 kbyte1.898,0 kbyte [filförteckning]
amd64 179,9 kbyte834,0 kbyte [filförteckning]
arm64 170,4 kbyte1.770,0 kbyte [filförteckning]
armel 163,2 kbyte691,0 kbyte [filförteckning]
armhf 162,4 kbyte583,0 kbyte [filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning) 174,6 kbyte716,0 kbyte [filförteckning]
i386 186,7 kbyte831,0 kbyte [filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning) 213,5 kbyte1.035,0 kbyte [filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning) 155,6 kbyte683,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 182,3 kbyte1.924,0 kbyte [filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning) 190,5 kbyte2.034,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 199,0 kbyte1.898,0 kbyte [filförteckning]
riscv64 180,8 kbyte682,0 kbyte [filförteckning]
s390x 186,6 kbyte802,0 kbyte [filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning) 179,3 kbyte1.747,0 kbyte [filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning) 166,3 kbyte23.868,0 kbyte [filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning) 174,9 kbyte796,0 kbyte [filförteckning]