Paket: hmmer (3.4+dfsg-2 och andra)

Länkar för hmmer

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet hmmer:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [hmmer.org]

Liknande paket:

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Märken: Biologi: Clustal/ALN, Proteiner, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Databases

Andra paket besläktade med hmmer

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.15) [hppa, m68k, sparc64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.15) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

fast suffix array construction

sug: hmmer-doc (>= 3.1b2-1) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

Hämta hmmer

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	1.129,7 kbyte	13.177,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	3.4+dfsg-2	1.037,5 kbyte	6.466,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	3.4+dfsg-2	932,4 kbyte	7.248,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	969,6 kbyte	10.721,0 kbyte	[filförteckning]
i386	3.4+dfsg-2	1.068,1 kbyte	6.187,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	850,4 kbyte	8.566,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	3.4+dfsg-2	1.011,3 kbyte	6.929,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	908,8 kbyte	8.358,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	840,5 kbyte	9.376,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	3.4+dfsg-2	1.049,1 kbyte	6.365,0 kbyte	[filförteckning]