Paket: hmmer (3.4+dfsg-2 och andra)

Länkar för hmmer

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet hmmer:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [hmmer.org]

Liknande paket:

Profilerade dolda Markov-modeller för proteinsekvensanalys

HMMER är en implementering av metoder för dolda Markovmodeller för

 känsliga sökningar i biologiska sekvensdatabaser med multipla

sekvensinriktningar sekvensinriktningar som frågor.

 .
 Med en multipel sekvensinriktning som indata bygger HMMER en statistisk

modell som kallas en ”dold Markov-modell” som sedan kan användas som en fråga i en sekvensdatabas för att hitta (och/eller aligna) ytterligare homologer av sekvensfamilj.

Märken: Biologi: Clustal/ALN, Proteiner, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::searching, works-with-format::plaintext, Works with: Databases

Andra paket besläktade med hmmer

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.15) [hppa, m68k, sparc64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.15) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

fast suffix array construction

sug: hmmer-doc (>= 3.1b2-1) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

Hämta hmmer

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	1.129,7 kbyte	13.177,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	3.4+dfsg-2	1.037,5 kbyte	6.466,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	3.4+dfsg-2+b2	957,1 kbyte	7.186,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	969,6 kbyte	10.721,0 kbyte	[filförteckning]
i386	3.4+dfsg-2	1.068,1 kbyte	6.187,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	850,4 kbyte	8.566,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	3.4+dfsg-2	1.011,3 kbyte	6.929,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	908,8 kbyte	8.358,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	3.1b2-1	840,5 kbyte	9.376,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	3.4+dfsg-2	1.049,1 kbyte	6.365,0 kbyte	[filförteckning]