Paket: libbio-db-hts-perl (3.01-5)

Länkar för libbio-db-hts-perl

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet libbio-db-hts-perl:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [metacpan.org]

Liknande paket:

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Andra paket besläktade med libbio-db-hts-perl

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libbio-perl-perl

BioPerl core perl modules
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.22) [ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, s390x]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: perl (>= 5.40.0-6)

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: perlapi-5.40.0

virtuellt paket som tillhandahålls av perl-base
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta libbio-db-hts-perl

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	139,1 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	133,7 kbyte	477,0 kbyte	[filförteckning]
armel	135,2 kbyte	415,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	134,5 kbyte	375,0 kbyte	[filförteckning]
i386	140,9 kbyte	447,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	136,6 kbyte	540,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	139,5 kbyte	403,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	139,3 kbyte	441,0 kbyte	[filförteckning]