alla flaggor
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Källkod: pairtools  ]

Paket: python3-pairtools (0.3.0-2 och andra)

Länkar för python3-pairtools

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet pairtools:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Andra paket besläktade med python3-pairtools

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta python3-pairtools

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Version Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 0.3.0-2+b2 121,3 kbyte440,0 kbyte [filförteckning]
arm64 0.3.0-2+b2 110,5 kbyte407,0 kbyte [filförteckning]
armel 0.3.0-2+b2 109,3 kbyte394,0 kbyte [filförteckning]
armhf 0.3.0-2+b2 109,4 kbyte342,0 kbyte [filförteckning]
i386 0.3.0-2+b2 119,7 kbyte426,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 0.3.0-2+b2 108,1 kbyte437,0 kbyte [filförteckning]
mipsel 0.3.0-2+b2 108,0 kbyte414,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 0.3.0-2+b2 120,3 kbyte479,0 kbyte [filförteckning]
s390x 0.3.0-2+b2 107,5 kbyte415,0 kbyte [filförteckning]