Balík: physamp (1.1.0-5 a iné)

Odkazy pre physamp

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík physamp:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [jydu.github.io]

Podobné balíky:

sample sequence alignment corresponding to phylogeny

The PhySamp package currently contains two programs: bppphysamp, which samples sequences according to their similarity, and bppalnoptim, which samples a sequence alignment by removing sequences in order to maximize the number of sites suitable for a given analysis. The bppalnoptim program has three running modes:

 * Interactive: the user will be iteratively proposed a set of choices
   for sequence removal, with their corresponding site gains. The
   procedure stops when the user does not want to remove more sequences,
   and the resulting filtered alignment is written.
 * Automatic: the user enters an a priori criterion for stopping
   the filtering procedure (for instance a minimum number of
   sequences to keep).
 * Diagnostic: this mode allows one to plot the trade-off curve, by
   showing the site gain as a function of the number of removed
   sequences.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom physamp

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Core library
dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Phylogenetic library
dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Sequence library
dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

podporná knižnica GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie arm64]

štandardná knižnica C++ GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
dep: libunwind8 [ia64]

nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

Stiahnuť physamp

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.1.0-5	181.2 kB	1,893.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.1.0-5	182.3 kB	1,774.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.1.0-5+b1	176.7 kB	1,827.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.1.0-5	169.6 kB	1,724.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.1.0-5	170.5 kB	1,660.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.1.0-5	186.0 kB	1,807.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.1.0-5	185.3 kB	1,768.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.1.0-5	193.3 kB	1,996.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	1.1.0-5	178.2 kB	1,780.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.1.0-5	178.1 kB	1,752.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.1.0-5	177.9 kB	1,912.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.1.0-5	187.3 kB	1,954.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.1.0-5	186.1 kB	1,890.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.1.0-5	182.1 kB	1,714.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.1.0-5	181.0 kB	1,790.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.1.0-5	188.5 kB	1,826.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.1.0-5	170.3 kB	3,497.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.1.0-5	180.4 kB	1,740.0 kB	[zoznam súborov]