Balík: mummer (3.23+dfsg-8) [debports]

Odkazy pre mummer

Zdroje Debian:

Hlásenia chýb

Stiahnuť zdrojový balík :

Nenájdený

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [mummer.sourceforge.net]

Podobné balíky:

Efficient sequence alignment of full genomes

MUMmer is a system for rapidly aligning entire genomes, whether in complete or draft form. For example, MUMmer 3.0 can find all 20-basepair or longer exact matches between a pair of 5-megabase genomes in 13.7 seconds, using 78 MB of memory, on a 2.4 GHz Linux desktop computer. MUMmer can also align incomplete genomes; it handles the 100s or 1000s of contigs from a shotgun sequencing project with ease, and will align them to another set of contigs or a genome using the NUCmer program included with the system. If the species are too divergent for DNA sequence alignment to detect similarity, then the PROmer program can generate alignments based upon the six-frame translations of both input sequences.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom mummer

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: gawk

GNU awk, jazyk na hľadanie a spracovanie vzoriek
dep: libc6.1 (>= 2.33)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 11)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

Stiahnuť mummer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	654.6 kB	3,963.0 kB	[zoznam súborov]