Balík: bali-phy (3.6.1+dfsg-2 a iné) [debports]

Odkazy pre bali-phy

Zdroje Debian:

Hlásenia chýb

Stiahnuť zdrojový balík :

Nenájdený

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [www.bali-phy.org]

Podobné balíky:

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bali-phy

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)

reprezentácia doby trvania, časového bodu a hodín v C++
dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

knižnica volieb programu pre C++
dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0)

knižnica Boost náhodných čísel
dep: libc6.1 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

2D vektorová grafická knižnica Cairo
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

rec: gnuplot

program na interaktívne kreslenie riadený z príkazového riadka
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

GNU R statistical computation and graphics system

sug: figtree

graphical phylogenetic tree viewer
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Stiahnuť bali-phy

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	3.6.1+dfsg-2+b1	6,091.7 kB	39,083.0 kB	[zoznam súborov]