[ Zdroj: megadepth ]
Balík: megadepth (1.2.0-4 a iné)
Odkazy pre megadepth
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík megadepth:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.
This package is a successor of the program 'bamcount'.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom megadepth
|
|
|
|
-
- dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)
- C library for handling bigWig files
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [nie arm64]
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armhf, i386, riscv64]
- podporná knižnica GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
Stiahnuť megadepth
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.2.0-4+b1 | 81.0 kB | 275.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 1.2.0-4+b2 | 72.4 kB | 275.0 kB | [zoznam súborov] |
| armhf | 1.2.0-4+b1 | 72.5 kB | 178.0 kB | [zoznam súborov] |
| i386 | 1.2.0-4+b1 | 84.1 kB | 274.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 1.2.0-4+b1 | 83.3 kB | 339.0 kB | [zoznam súborov] |
| riscv64 | 1.2.0-4+b2 | 79.8 kB | 219.0 kB | [zoznam súborov] |
| s390x | 1.2.0-4+b1 | 82.1 kB | 271.0 kB | [zoznam súborov] |