[ buster ]
[ Zdroj: pbalign ]
Balík: pbalign (0.3.2-1)
Odkazy pre pbalign
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík pbalign:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences
pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.
This package is part of the SMRTAnalysis suite.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom pbalign
|
|
|
|
-
- dep: blasr (>= 5.3+0)
- mapping single-molecule sequencing reads
-
- dep: python
- interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (verzia python2)
-
- dep: python-pbalign (= 0.3.2-1)
- map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)
-
- dep: python-pkg-resources
- objavovanie balíkov a prístup k zdrojom prostredníctvom pkg_resources
-
- rec: hdf5-tools
- HDF5 (Hierarchical Data Format 5) - nástroje
-
- rec: python-pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library
-
- sug: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- sug: gmap
- spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
-
- sug: pbalign-doc
- documentation for pbalign
Stiahnuť pbalign
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| all | 9.3 kB | 44.0 kB | [zoznam súborov] |