Balík: profphd (1.0.42-3)

Odkazy pre profphd

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík profphd:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [predictprotein.org]

Podobné balíky:

predpovedanie sekundárnej štruktúry a prístupnosti rozpúšťadiel

Tento balík poskytuje program prof(1) na predpovedanie sekundárnej štruktúry, prístupnosti a transmembránovej závitnice, ktorého autorom je Burkhard Rost. Predpoveď sa vytvorí buď len zo samotnej sekvencie bielkovín alebo zo zarovnania. Druhý prípad by ste mali používať kvôli optimálnemu výkonu.

Aké dosahuje prof(1) výsledky?

 * sekundárnu štruktúru predpovedá s očakávanou priemernou presnosťou
   > 72 % pre tri stavy závitnica, vlákno a slučka

 * prístupnosť rozpúšťadiel predpovedá s koeficientom korelácie 0,54 (medzi
   experimentálne pozorovanou a predpovedanou relatívnou prístupnosťou
   rozpúšťadiel)

 * predpovedanie transmembránovej závitnice má očakávanú per-reziduálnu
   presnosť okolo 95 %. Počet falošných pozitív, t.j. transmembránových
   závitníc predpovedaných v globulárnych bielkovinách je okolo 2 %.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom profphd

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: librg-utils-perl

parsers and format conversion utilities used by (e.g.) profphd
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
dep: profnet-prof

neural network architecture for profacc
dep: profphd-net

architektúra neurónových sietí pre profphd
dep: profphd-utils

pomocné nástroje profphd convert_seq a filter_hssp

rec: pp-popularity-contest

PredictProtein popularity contest

Stiahnuť profphd

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	4,404.7 kB	26,199.0 kB	[zoznam súborov]