Balík: changeo (0.4.5-1)
Odkazy pre changeo
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík changeo:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [changeo.readthedocs.io]
Podobné balíky:
Repertoire clonal assignment toolkit (Python 3)
Change-O is a collection of tools for processing the output of V(D)J alignment tools, assigning clonal clusters to immunoglobulin (Ig) sequences, and reconstructing germline sequences.
Dramatic improvements in high-throughput sequencing technologies now enable large-scale characterization of Ig repertoires, defined as the collection of trans-membrane antigen-receptor proteins located on the surface of B cells and T cells. Change-O is a suite of utilities to facilitate advanced analysis of Ig and TCR sequences following germline segment assignment. Change-O handles output from IMGT/HighV-QUEST and IgBLAST, and provides a wide variety of clustering methods for assigning clonal groups to Ig sequences. Record sorting, grouping, and various database manipulation operations are also included.
This package installs the library for Python 3.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom changeo
|
|
|
|
-
- dep: python3
- interaktívny vysokoúrovňový objektovo orientovaný jazyk (predvolená verzia python3)
-
- dep: python3-biopython
- knižnica na bioinformatiku implementovaná v jazyku Python 3
-
- dep: python3-numpy
- schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3
-
- dep: python3-pandas
- údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“ - Python 3
-
- dep: python3-pkg-resources
- objavovanie balíkov a prístup k zdrojom prostredníctvom pkg_resources
-
- dep: python3-scipy
- vedecké nástroje pre Python 3
-
- dep: python3-yaml
- spracovanie a tvorbu YAML v jazyku Python 3
-
- rec: python3-airr
- Data Representation Standard library for antibody and TCR sequences
-
- rec: python3-biopython (>= 1.65)
- knižnica na bioinformatiku implementovaná v jazyku Python 3
-
- rec: python3-pandas (>= 0.15)
- údajové štruktúry „relačných“ dát alebo dát „s označením“ - Python 3
-
- rec: python3-presto
- toolkit for processing B and T cell sequences
-
- rec: python3-scipy (>= 0.14)
- vedecké nástroje pre Python 3
Stiahnuť changeo
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| all | 88.0 kB | 620.0 kB | [zoznam súborov] |