[ Zdroj: allelecount ]
Balík: liballelecount-perl (4.2.1-1)
Odkazy pre liballelecount-perl
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík allelecount:
Správcovia:
Externé zdroje:
- Domovská stránka [github.com]
Podobné balíky:
Perl interface to NGS copy number algorithms
Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).
The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.
This package provided the Perl interface to alleleCounter providing Sanger::CGP::AlleleCount::Genotype.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom liballelecount-perl
|
|
|
|
-
- dep: libconst-fast-perl
- facility for creating read-only scalars, arrays, and hashes
-
- dep: libdevel-cover-perl
- Perl tool for determining code coverage metrics
-
- dep: libfile-slurp-perl
- rutiny na čítanie a zápis súboru jediným volaním
-
- dep: libfile-which-perl
- modul Perlu na nájdenie ciest k spustiteľným programom
-
- dep: libipc-system-simple-perl
- modul Perlu na jednoduché spúšťanie príkazov s podrobnou diagnostikou
-
- dep: libpod-coverage-perl
- kontrola úplnosti dokumentácie modul jazyka Perl
-
- dep: libtest-fatal-perl (>= 0.013)
- modul na testovanie kódu s výnimkami
-
- dep: libtry-tiny-perl
- modul poskytujúci minimalistický try/catch
-
- dep: perl
- Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
Stiahnuť liballelecount-perl
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| all | 20.5 kB | 70.0 kB | [zoznam súborov] |