[ Zdroj: prime-phylo ]
Balík: prime-phylo (1.0.11-9 a iné)
Odkazy pre prime-phylo
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík prime-phylo:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Erik Sjolund (Stránka QA)
- Andreas Tille (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [prime.sbc.su.se]
Podobné balíky:
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.
The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom prime-phylo
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- referenčné implementácie základnej lineárnej algebry - zdieľaná knižnica
- alebo libblas.so.3
- virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libboost-mpi1.74.0 (>= 1.74.0)
- rozhranie jazyka C++ ku MPI (Message Passing Interface)
-
- dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)
- knižnica na serializáciu pre C++
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: liblapack3
- knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - zdieľaná knižnica
- alebo liblapack.so.3
- virtuálny balík poskytovaný balíkom libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)
- knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: libxml2 (>= 2.7.4)
- knižnica GNOME XML
-
- dep: perl
- Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
-
- sug: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- sug: mrbayes
- Bayesian Inference of Phylogeny
-
- sug: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- sug: njplot
- program na kreslenie fylogenetických stromov
-
- sug: phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- sug: probalign
- multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
-
- sug: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- sug: raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
-
- sug: treeviewx
- Displays and prints phylogenetic trees
Stiahnuť prime-phylo
| Architektúra | Verzia | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.0.11-9+b1 | 802.3 kB | 3,138.0 kB | [zoznam súborov] |