Balík: bowtie2 (2.4.2-2 a iné)

Odkazy pre bowtie2

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík bowtie2:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [bowtie-bio.sourceforge.net]

Podobné balíky:

ultrafast memory-efficient short read aligner

is an ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences. It is particularly good at aligning reads of about 50 up to 100s or 1,000s of characters, and particularly good at aligning to relatively long (e.g. mammalian) genomes.

Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index to keep its memory footprint small: for the human genome, its memory footprint is typically around 3.2 GB. Bowtie 2 supports gapped, local, and paired-end alignment modes

Značky: Biológia: Nucleic Acids, Pole: Biológia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biologické sekvencie

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bowtie2

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 9)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: libtbb2 (>= 2017~U7)

knižnica paralelizmu pre jazyk C++ - dynamické súbory
dep: perl

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

sug: bowtie2-examples

Examples for bowtie2

Stiahnuť bowtie2

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2.4.2-2+b3	1,310.9 kB	5,305.0 kB	[zoznam súborov]