Пакет: mindthegap (2.3.0-3 и другие) [debports]

Ссылки для mindthegap

Ресурсы Debian:

Сообщения об ошибках

Исходный код :

Не найден

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

performs detection and assembly of DNA insertion variants in NGS read datasets

Designed to call insertions of any size, whether they are novel or duplicated, homozygous or heterozygous in the donor genome. It takes as input a set of reads and a reference genome. It outputs two sets of FASTA sequences: one is the set of breakpoints of detection insertion sites, the other is the set of assembled insertions for each breakpoint. MindTheGap can also be used as a genome assembly finishing tool. It can fill the gaps between a set of input contigs without any a priori on their relative order and orientation. It outputs the results in gfa file.

Другие пакеты, относящиеся к mindthegap

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg-7)

dynamic library of the Genome Analysis Toolbox
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libhdf5-103-1t64

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка mindthegap

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
x32 (неофициальный перенос)	2.3.0-3+b1	244,9 Кб	937,0 Кб	[список файлов]