Пакет: megadepth (1.2.0-4 и другие) [debports]
Ссылки для megadepth
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.
This package is a successor of the program 'bamcount'.
Другие пакеты, относящиеся к megadepth
|
|
|
|
-
- dep: libbigwig0t64 (>= 0.4.6)
- C library for handling bigWig files
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
Загрузка megadepth
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| x32 (неофициальный перенос) | 1.2.0-4+b1 | 83,8 Кб | 258,0 Кб | [список файлов] |