Пакет: canu (2.2+dfsg-5) [debports]

Ссылки для canu

Ресурсы Debian:

Сообщения об ошибках

Исходный код :

Не найден

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [canu.readthedocs.org]

Подобные пакеты:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Другие пакеты, относящиеся к canu

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: gnuplot-nox

Command-line driven interactive plotting program. No-X package
также виртуальный пакет, предоставляемый gnuplot-qt, gnuplot-x11

или gnuplot

утилита для построения графиков с интерфейсом командной строки
также виртуальный пакет, предоставляемый gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libsnappy1v5 (>= 1.1.10)

fast compression/decompression library
dep: libstdc++6 (>= 11)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: mhap

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

sug: nanopolish

consensus caller for nanopore sequencing data

Загрузка canu

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
x32 (неофициальный перенос)	1 386,5 Кб	12 548,0 Кб	[список файлов]