все параметры
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: trf  ]

Пакет: trf (4.09.1-6 и другие)

Ссылки для trf

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код trf:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

locate and display tandem repeats in DNA sequences

A tandem repeat in DNA is two or more adjacent, approximate copies of a pattern of nucleotides. Tandem Repeats Finder is a program to locate and display tandem repeats in DNA sequences. In order to use the program, the user submits a sequence in FASTA format. There is no need to specify the pattern, the size of the pattern or any other parameter. The output consists of two files: a repeat table file and an alignment file. The repeat table, viewable in a web browser, contains information about each repeat, including its location, size, number of copies and nucleotide content. Clicking on the location indices for one of the table entries opens a second browser page that shows an alignment of the copies against a consensus pattern. The program is very fast, analyzing sequences on the order of .5Mb in just a few seconds. Submitted sequences may be of arbitrary length. Repeats with pattern size in the range from 1 to 2000 bases are detected.

Другие пакеты, относящиеся к trf

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка trf

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 4.09.1-6 56,9 Кб183,0 Кб [список файлов]
amd64 4.09.1-6 56,9 Кб167,0 Кб [список файлов]
arm64 4.09.1-6 52,9 Кб183,0 Кб [список файлов]
armel 4.09.1-6 55,4 Кб182,0 Кб [список файлов]
armhf 4.09.1-6 53,0 Кб182,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 4.09.1-6 54,3 Кб159,0 Кб [список файлов]
i386 4.09.1-6 55,7 Кб166,0 Кб [список файлов]
ia64 (неофициальный перенос) 4.09.1-6 68,7 Кб231,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 4.09.1-6 51,6 Кб158,0 Кб [список файлов]
mips64el 4.09.1-6 55,3 Кб187,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 4.09.1-6 58,6 Кб183,0 Кб [список файлов]
ppc64el 4.09.1-6 58,0 Кб183,0 Кб [список файлов]
riscv64 4.09.1-6+b1 55,4 Кб148,0 Кб [список файлов]
s390x 4.09.1-6 53,8 Кб163,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 4.09.1-6 59,4 Кб182,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 4.09.1-6 53,6 Кб1 080,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 4.09.1-6 54,8 Кб154,0 Кб [список файлов]