все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: sigma-align  ]

Пакет: sigma-align (1.1.3-9)

Ссылки для sigma-align

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код sigma-align:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Simple greedy multiple alignment of non-coding DNA sequences

Sigma (“Simple greedy multiple alignment”) is an alignment program. It's algorithm and scoring scheme are designed specifically for non-coding DNA sequence.

It uses a strategy of seeking the best possible gapless local alignments. This happens at each step making the best possible alignment consistent with existing alignments. It scores the significance of the alignment based on the lengths of the aligned fragments and a background model. These may be supplied or estimated from an auxiliary file of intergenic DNA.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::analysing, use::comparing, Поддерживаемые форматы: Простой текст, Работает с: Требуется дополнительный тег

Другие пакеты, относящиеся к sigma-align

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка sigma-align

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
alpha (неофициальный перенос) 23,0 Кб89,0 Кб [список файлов]
amd64 23,0 Кб61,0 Кб [список файлов]
arm64 22,1 Кб89,0 Кб [список файлов]
armel 22,1 Кб56,0 Кб [список файлов]
armhf 20,2 Кб48,0 Кб [список файлов]
hppa (неофициальный перенос) 22,6 Кб57,0 Кб [список файлов]
i386 23,7 Кб60,0 Кб [список файлов]
ia64 (неофициальный перенос) 28,3 Кб86,0 Кб [список файлов]
m68k (неофициальный перенос) 20,1 Кб56,0 Кб [список файлов]
mips64el 23,0 Кб91,0 Кб [список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос) 25,8 Кб89,0 Кб [список файлов]
ppc64el 26,2 Кб89,0 Кб [список файлов]
riscv64 23,3 Кб53,0 Кб [список файлов]
s390x 24,0 Кб65,0 Кб [список файлов]
sh4 (неофициальный перенос) 23,8 Кб88,0 Кб [список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос) 21,2 Кб1 050,0 Кб [список файлов]
x32 (неофициальный перенос) 22,9 Кб56,0 Кб [список файлов]