Пакет: fastahack (1.0.0+dfsg-11 и другие)

Ссылки для fastahack

Ресурсы Debian:

Исходный код libfastahack:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

utility for indexing and sequence extraction from FASTA files

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

Другие пакеты, относящиеся к fastahack

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f)

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка fastahack

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b1	12,1 Кб	86,0 Кб	[список файлов]