Пакет: libjellyfish-2.0-2 (2.3.1-3 и другие)
Ссылки для libjellyfish-2.0-2
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код jellyfish:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Shaun Jackman (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Michael R. Crusoe (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [www.genome.umd.edu]
Подобные пакеты:
count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.
This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.
Другие пакеты, относящиеся к libjellyfish-2.0-2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [не ia64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не hppa, ia64]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не ia64]
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
Загрузка libjellyfish-2.0-2
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.3.1-3+b3 | 65,6 Кб | 205,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 2.3.1-3+b3 | 60,7 Кб | 220,0 Кб | [список файлов] |
| hppa (неофициальный перенос) | 2.3.1-2+b1 | 66,9 Кб | 208,0 Кб | [список файлов] |
| ia64 (неофициальный перенос) | 2.3.0-12 | 75,2 Кб | 315,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 2.3.1-3+b4 | 60,7 Кб | 233,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 2.3.1-3+b4 | 69,6 Кб | 285,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 2.3.1-3+b4 | 65,0 Кб | 172,0 Кб | [список файлов] |