Пакет: miniasm (0.3+dfsg-4) [debports]

Ссылки для miniasm

Ресурсы Debian:

Сообщения об ошибках

Исходный код :

Не найден

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Другие пакеты, относящиеся к miniasm

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Загрузка miniasm

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
hppa (неофициальный перенос)	29,3 Кб	67,0 Кб	[список файлов]