Пакет: maffilter (1.3.1+dfsg-6) [debports]

Ссылки для maffilter

Ресурсы Debian:

Сообщения об ошибках

Исходный код :

Не найден

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [jydu.github.io]

Подобные пакеты:

process genome alignment in the Multiple Alignment Format

MafFilter applies a series of "filters" to a MAF file, in order to clean it, extract data and computer statistics while keeping track of the associated meta-data such as genome coordinates and quality scores.

 * It can process the alignment to remove low-quality / ambiguous /
   masked regions.
 * It can export data into a single or multiple alignment file in
   format such as Fasta or Clustal.
 * It can read annotation data in GFF or GTF format, and extract the
   corresponding alignment.
 * It can perform sliding windows calculations.
 * It can reconstruct phylogeny/genealogy along the genome alignment.
 * It can compute population genetics statistics, such as site
   frequency spectrum, number of fixed/polymorphic sites, etc.

Другие пакеты, относящиеся к maffilter

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

библиотека Boost.Iostreams
dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Core library
dep: libbpp-phyl-omics3t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Phylogenetics library: genomics components
dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Phylogenetic library
dep: libbpp-seq-omics3t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Sequence library: genomics components
dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Sequence library
dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

sug: maffilter-examples

process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)

Загрузка maffilter

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
hppa (неофициальный перенос)	248,4 Кб	1 250,0 Кб	[список файлов]