Пакет: dascrubber (1.1-4 и другие)

Ссылки для dascrubber

Ресурсы Debian:

Исходный код dascrubber:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [dazzlerblog.wordpress.com]

Подобные пакеты:

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Другие пакеты, относящиеся к dascrubber

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

dep: libc6 (>= 2.7) [не alpha, arm64, ia64, loong64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

sug: daligner

выравнивание длинных нуклеотидных последовательностей
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

Загрузка dascrubber

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.1-4	159,8 Кб	1 381,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.1-4	163,9 Кб	1 185,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.1-4+b1	155,0 Кб	1 534,0 Кб	[список файлов]
armel	1.1-4	139,8 Кб	1 139,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.1-4	137,6 Кб	803,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.1-4	150,4 Кб	1 169,0 Кб	[список файлов]
i386	1.1-4	157,6 Кб	1 327,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.1-4	185,4 Кб	2 282,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.1-4	144,8 Кб	1 133,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.1-4	141,1 Кб	1 139,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.1-4	135,7 Кб	1 217,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.1-4	154,2 Кб	1 725,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.1-4	165,7 Кб	1 789,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.1-4+b1	166,3 Кб	930,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.1-4	155,1 Кб	1 237,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.1-4	159,6 Кб	999,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.1-4	130,1 Кб	1 159,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.1-4	158,9 Кб	1 151,0 Кб	[список файлов]