Пакет: density-fitness (1.0.8-4)

Ссылки для density-fitness

Ресурсы Debian:

Исходный код density-fitness:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Другие пакеты, относящиеся к density-fitness

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1)

Library files for libcifpp
dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

object oriented library for crystallographic computing
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5)

Library file for libpdb-redo
dep: libstdc++6 (>= 11)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8)

Library file for libzeep
dep: zlib1g (>= 1:1.2.2)

библиотека сжатия

Загрузка density-fitness

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	448,0 Кб	5 548,0 Кб	[список файлов]