все параметры
experimental  ]
[ Источник: libssw  ]

Пакет: libssw1 (1.2.5-1)

Ссылки для libssw1

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код libssw:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Экспериментальный пакет

Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Другие пакеты, относящиеся к libssw1

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка libssw1

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
i386 25,2 Кб80,0 Кб [список файлов]