Пакет: blixem (4.44.1+dfsg-3)

Ссылки для blixem

Ресурсы Debian:

Исходный код seqtools:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.sanger.ac.uk]

Подобные пакеты:

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Теги: Инструментарий интерфейса: GTK

Другие пакеты, относящиеся к blixem

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libatk1.0-0 (>= 1.12.4)

инструментарий специальных возможностей ATK
dep: libc6 (>= 2.4)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

библиотека для двухмерной векторной графики Cairo
dep: libcurl4 (>= 7.16.2)

простая в использовании клиентская библиотека для передачи URL (вариант с OpenSSL)
dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6)

общая библиотека настроек шрифтов (динамическая версия)
dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

движок отрисовки шрифтов FreeType 2 (динамически загружаемые библиотеки)
dep: libgbtools0

library for visualising sequence alignments
dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)

библиотека GDK Pixbuf
dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)

библиотека С-функций
dep: libgtk2.0-0 (>= 2.14.0)

библиотека графического пользовательского интерфейса GTK+
dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

library for reading and writing JSON for C++
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках
dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках
dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0)

библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

динамически подключаемая библиотека SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка blixem

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armhf	292,9 Кб	739,0 Кб	[список файлов]