все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: roary  ]

Пакет: roary (3.12.0+dfsg-2)

Ссылки для roary

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код roary:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

high speed stand alone pan genome pipeline

Roary is a high speed stand alone pan genome pipeline, which takes annotated assemblies in GFF3 format (as produced, for instance, by Prokka) and calculates the pan genome. Using a standard desktop PC, it can analyse datasets with thousands of samples, something which is computationally infeasible with existing methods, without compromising the quality of the results. 128 samples can be analysed in under 1 hour using 1 GB of RAM and a single processor. To perform this analysis using existing methods would take weeks and hundreds of GB of RAM. Roary is not intended for meta-genomics or for comparing extremely diverse sets of genomes.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::perl, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::analysing, use::comparing

Другие пакеты, относящиеся к roary

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка roary

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
all 171,7 Кб659,0 Кб [список файлов]