[ bullseye ]
[ Источник: r-bioc-bitseq ]
Пакет: r-bioc-bitseq (1.34.0+dfsg-1)
Ссылки для r-bioc-bitseq
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код r-bioc-bitseq:
- [r-bioc-bitseq_1.34.0+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-bitseq_1.34.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-bitseq_1.34.0+dfsg-1.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [bioconductor.org]
Подобные пакеты:
transcript expression inference and analysis for RNA-seq data
The BitSeq package is targeted for transcript expression analysis and differential expression analysis of RNA-seq data in two stage process. In the first stage it uses Bayesian inference methodology to infer expression of individual transcripts from individual RNA-seq experiments. The second stage of BitSeq embraces the differential expression analysis of transcript expression. Providing expression estimates from replicates of multiple conditions, Log-Normal model of the estimates is used for inferring the condition mean transcript expression and ranking the transcripts based on the likelihood of differential expression.
Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-bitseq
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libcurl4 (>= 7.18.0)
- простая в использовании клиентская библиотека для передачи URL (вариант с OpenSSL)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
- вспомогательная библиотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, i386]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: r-api-4.0
- виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.12
- виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- GNU R core of statistical computation and graphics system
-
- dep: r-bioc-iranges
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
-
- dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.15.5)
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.3)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
-
- dep: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-deseq
- GNU R differential gene expression analysis
-
- sug: r-bioc-edger
- Empirical analysis of digital gene expression data in R
Загрузка r-bioc-bitseq
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 1 104,1 Кб | 5 998,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 1 062,4 Кб | 5 890,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 1 047,6 Кб | 5 594,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 1 135,7 Кб | 6 077,0 Кб | [список файлов] |