все параметры
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: plip  ]

Пакет: plip (2.1.7+dfsg-1)

Ссылки для plip

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код plip:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

fully automated protein-ligand interaction profiler

The Protein-Ligand Interaction Profiler (PLIP) is a tool to analyze and visualize protein-ligand interactions in PDB files.

Features include: 

 * Detection of eight different types of noncovalent interactions
 * Automatic detection of relevant ligands in a PDB file
 * Direct download of PDB structures from wwPDB server if valid
   PDB ID is given
 * Processing of custom PDB files containing protein-ligand complexes
   (e.g. from docking)
 * No need for special preparation of a PDB file, works out of the box
 * Atom-level interaction reports in rST and XML formats for easy parsing
 * Generation of PyMOL session files (.pse) for each pairing, enabling easy
   preparation of images for publications and talks
 * Rendering of preview image for each ligand and its interactions
   with the protein

Другие пакеты, относящиеся к plip

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка plip

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
all 80,6 Кб376,0 Кб [список файлов]