Пакет: miniasm (0.3+dfsg-2)

Ссылки для miniasm

Ресурсы Debian:

Исходный код miniasm:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Теги: Биология: Нуклеиновые кислоты, Область: Биология, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, science::calculation, Цель: Вычислительный, use::comparing, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к miniasm

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

библиотека сжатия

rec: minimap

tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads

Загрузка miniasm

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	29,6 Кб	70,0 Кб	[список файлов]
arm64	27,8 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
armel	28,3 Кб	66,0 Кб	[список файлов]
armhf	26,8 Кб	54,0 Кб	[список файлов]
i386	31,9 Кб	74,0 Кб	[список файлов]
mips64el	30,4 Кб	78,0 Кб	[список файлов]
mipsel	30,0 Кб	77,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	32,6 Кб	83,0 Кб	[список файлов]
s390x	28,5 Кб	74,0 Кб	[список файлов]