все параметры
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: libfastahack  ]

Пакет: libfastahack0 (1.0.0+dfsg-7)

Ссылки для libfastahack0

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код libfastahack:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features: 

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Другие пакеты, относящиеся к libfastahack0

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка libfastahack0

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 25,0 Кб83,0 Кб [список файлов]
arm64 23,1 Кб75,0 Кб [список файлов]
armel 23,3 Кб69,0 Кб [список файлов]
armhf 23,7 Кб57,0 Кб [список файлов]
i386 27,4 Кб81,0 Кб [список файлов]
mips64el 24,3 Кб82,0 Кб [список файлов]
mipsel 25,0 Кб79,0 Кб [список файлов]
ppc64el 26,3 Кб87,0 Кб [список файлов]
s390x 22,8 Кб77,0 Кб [список файлов]