все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: alien-hunter  ]

Пакет: alien-hunter (1.7-8)

Ссылки для alien-hunter

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код alien-hunter:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Interpolated Variable Order Motifs to identify horizontally acquired DNA

Alien_hunter is an application for the prediction of putative Horizontal Gene Transfer (HGT) events with the implementation of Interpolated Variable Order Motifs (IVOMs). An IVOM approach exploits compositional biases using variable order motif distributions and captures more reliably the local composition of a sequence compared to fixed-order methods. Optionally the predictions can be parsed into a 2-state 2nd order Hidden Markov Model (HMM), in a change-point detection framework, to optimize the localization of the boundaries of the predicted regions. The predictions (embl format) can be automatically loaded into Artemis genome viewer freely available at: http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/.

Теги: Область: Биология, Структурная биология, Реализовано на: implemented-in::java, implemented-in::perl, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: role::program, scope::utility, Цель: Анализ

Другие пакеты, относящиеся к alien-hunter

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка alien-hunter

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
all 27,6 Кб112,0 Кб [список файлов]