Пакет: qcumber (2.3.0-2)

Ссылки для qcumber

Ресурсы Debian:

Исходный код qcumber:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [gitlab.com]

Подобные пакеты:

quality control of genomic sequences

QCPipeline is a tool for quality control. The workflow is as follows:

 1. Quality control with FastQC
 2. Trim Reads with Trimmomatic
 3. Quality control of trimmed reads with FastQC
 4. Map reads against reference using bowtie2
 5. Classify reads with Kraken

Другие пакеты, относящиеся к qcumber

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: debconf (>= 0.5)

система настройки пакетов Debian

или debconf-2.0

виртуальный пакет, предоставляемый cdebconf, cdebconf-udeb, debconf
dep: libjs-angularjs

lets you write client-side web applications as if you had a smarter browser
dep: libjs-bootstrap

HTML, CSS and JS framework
dep: libjs-d3

JavaScript visualization library for HTML and SVG
dep: libjs-jquery

JavaScript library for dynamic web applications
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-jinja2

small but fast and easy to use stand-alone template engine
dep: python3-matplotlib

Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)
dep: r-base-core

GNU R core of statistical computation and graphics system
dep: r-bioc-savr

GNU R parse and analyze Illumina SAV files
dep: r-cran-ggplot2

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-quantreg

GNU R package for quantile regression
dep: snakemake

pythonic workflow management system

Загрузка qcumber

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	49,3 Кб	236,0 Кб	[список файлов]