Пакет: ampliconnoise (1.29-9)

Ссылки для ampliconnoise

Ресурсы Debian:

Исходный код ampliconnoise:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Теги: Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к ampliconnoise

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgsl25 (>= 2.6)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

rec: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

Загрузка ampliconnoise

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1 080,6 Кб	2 036,0 Кб	[список файлов]
arm64	1 073,3 Кб	1 960,0 Кб	[список файлов]
armel	1 065,4 Кб	1 955,0 Кб	[список файлов]
armhf	1 061,2 Кб	1 819,0 Кб	[список файлов]
i386	1 078,5 Кб	2 011,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1 073,7 Кб	2 022,0 Кб	[список файлов]
mipsel	1 070,4 Кб	1 973,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1 093,8 Кб	2 592,0 Кб	[список файлов]
s390x	1 073,6 Кб	2 012,0 Кб	[список файлов]