[ Источник: allelecount ]
Пакет: liballelecount-perl (4.2.1-1)
Ссылки для liballelecount-perl
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код allelecount:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
Perl interface to NGS copy number algorithms
Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).
The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.
This package provided the Perl interface to alleleCounter providing Sanger::CGP::AlleleCount::Genotype.
Другие пакеты, относящиеся к liballelecount-perl
|
|
|
|
-
- dep: libconst-fast-perl
- facility for creating read-only scalars, arrays, and hashes
-
- dep: libdevel-cover-perl
- Perl tool for determining code coverage metrics
-
- dep: libfile-slurp-perl
- single call read & write file routines
-
- dep: libfile-which-perl
- Perl module for searching paths for executable programs
-
- dep: libipc-system-simple-perl
- Perl module to run commands simply, with detailed diagnostics
-
- dep: libpod-coverage-perl
- checker for comprehensiveness of perl module documentation
-
- dep: libtest-fatal-perl (>= 0.013)
- module for testing code with exceptions
-
- dep: libtry-tiny-perl
- module providing minimalistic try/catch
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
Загрузка liballelecount-perl
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| all | 20,5 Кб | 70,0 Кб | [список файлов] |