все параметры
[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: jellyfish  ]

Пакет: libjellyfish-2.0-2 (2.3.0-15 и другие)

Ссылки для libjellyfish-2.0-2

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код jellyfish:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.

Другие пакеты, относящиеся к libjellyfish-2.0-2

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка libjellyfish-2.0-2

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Версия Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 2.3.0-15+b3 61,7 Кб192,0 Кб [список файлов]
arm64 2.3.0-15+b3 57,4 Кб219,0 Кб [список файлов]
armel 2.3.0-15+b3 53,1 Кб163,0 Кб [список файлов]
armhf 2.3.0-15+b3 54,0 Кб135,0 Кб [список файлов]
i386 2.3.0-15+b3 68,8 Кб195,0 Кб [список файлов]
mips64el 2.3.0-15+b3 58,4 Кб232,0 Кб [список файлов]
ppc64el 2.3.0-15+b3 67,4 Кб284,0 Кб [список файлов]