все параметры
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: tophat-recondition  ]

Пакет: tophat-recondition (1.4-3)

Ссылки для tophat-recondition

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код tophat-recondition:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

post-processor for TopHat unmapped reads

tophat-recondition is a post-processor for TopHat unmapped reads (contained in unmapped.bam), making them compatible with downstream tools (e.g., the Picard suite, samtools, GATK) (TopHat issue #17). It also works around bugs in TopHat:

 * the "mate is unmapped" SAM flag is not set on any reads in the
   unmapped.bam file (TopHat issue #3)
 * the mapped mate of an unmapped read can be absent from
   accepted_hits.bam, creating a mismatch between the file and the unmapped
   read's flags (TopHat issue #16)

Другие пакеты, относящиеся к tophat-recondition

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка tophat-recondition

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
all 10,9 Кб36,0 Кб [список файлов]