Pakiet: murasaki (1.68.6-13 i inne) [debports]

Odnośniki dla murasaki

Zasoby systemu Debian:

Raporty o błędach

Pobieranie pakietu źródłowego :

Nie znaleziono

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Podobne pakiety:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Inne pakiety związane z murasaki

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0+ds1)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1)

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libboost-regex1.74.0-icu72

pakiet wirtualny udostępniany przez libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Pobieranie murasaki

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
x32 (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	481,2 KiB	2 773,0 KiB	[lista plików]