Pakiet: prime-phylo (1.0.11-11) [debports]
Odnośniki dla prime-phylo
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [prime.sbc.su.se]
Podobne pakiety:
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.
The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.
Inne pakiety związane z prime-phylo
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona
- lub libblas.so.3
- pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)
-
- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)
- serialization library for C++
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: liblapack3
- Library of linear algebra routines 3 - shared version
- lub liblapack.so.3
- pakiet wirtualny udostępniany przez libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: libxml2 (>= 2.7.4)
- Biblioteka GNOME XML
-
- dep: perl
- praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
-
- sug: mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
-
- sug: mrbayes
- Bayesian Inference of Phylogeny
-
- sug: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- sug: njplot
- phylogenetic tree drawing program
-
- sug: phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
-
- sug: probalign
- multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
-
- sug: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- sug: raxml
- Randomizowane maksymalne prawdopodobieństwo drzew filogenetycznych
-
- sug: treeviewx
- Wyświetla i drukuje drzewa filogenetyczne
Pobieranie prime-phylo
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| ppc64 (port nieoficjalny) | 817,3 KiB | 4 212,0 KiB | [lista plików] |